返答に困りますが、コメントありがとうございます。

前からそうなのですが、全ての情報を検索エンジンが公開しているわけではないので…………….

大変貴重なコメントありがとうございます。

確かに2004年当時は2サイトとも問題なく
インデックスされていたのかもしれません。

>フィルタリングの関係で要望があって残している、なんて可能性もないとはいえないかな、と思います。

別ドメイン運営にそんな目的があるとは考えもしませんでした。

>coolwebさん

インデックス削除されている時点でSEOとは言えないのでは？

2004年には同一コンテンツの排除がそれほど精度良くなされてはいなかった記憶がありますので、当時に統一処理したまま放置して忘れているだけなのかも知れません。むしろ複数が同時に出てきて占拠できてしまったくらいの時期じゃないでしょうか。

なお、私もいくつか似たようなことをしたサイトがありました。これは、一部プロバイダでDNSが時々正常に引けない会社があり、不定期にアクセスできなくなるユーザが居まして、別のドメイン名ならアクセスできるとのことで対策として複数のドメインで同じ内容を提供する羽目になっていたのでした。ですので、たとえばフィルタリングの関係で要望があって残している、なんて可能性もないとはいえないかな、と思います。